Por sus fondos museográficos y la forma de exponer sus materiales, podemos denominarlo como una colección específica de las ciencias aplicadas y de la salud, cuyo valor añadido se encuentra en que es la única en España que muestra la evolución de la Veterinaria Militar hasta la actualidad.
Sala 1
Colección de instrumentos y material de laboratorio, compuesta por instrumentos y materiales empleados en los laboratorios.
Colección de botamen de Farmacia Veterinaria, que consta de 130 botes para la preparación de recetas magistrales y almacenamiento de simples.
Colección de material de campaña reglamentario, constituida por los equipos de inspección de alimentos.
Sala 2
Colección de instrumentos quirúrgicos, compuesta por piezas fabricadas en la Fábrica de Armas de Toledo y otros de dotación de los Oficiales Veterinarios en el siglo XX.
Colección de maquetas docentes de veterinaria, que muestra el material reglamentario anterior a 1945.
Colección de material de campaña reglamentario, constituida por los equipos de desinfección, desratización y desinsectación, botiquín de ganado y cajas anexas reglamentarias entre 1908 y 1986 y equipos de lucha biológica.
Sala 3
Colección de podología y arte de herrar, compuesta por fraguas de campaña desde 1917, instrumentos de fragua y forja y herraduras ortopédicas.
