En la actualidad, el Archivo Intermedio Militar Centro custodia fondos documentales procedentes de 124 unidades productoras diferentes, todas dentro del ámbito geográfico asignado y constituyendo un total aproximado de 33000 cajas normalizadas de archivo, 6000 legajos, 5000 libros y 2037 documentos cartográficos. Esta documentación está, fundamentalmente, en soporte papel aunque existe una cantidad reducida de fotografías. Las fechas extremas de la documentación son, en general, del año 1939 al 2005, aunque se custodia un número reducido de documentos fechados entre 1832 y 1939. La tipología documental es variada: documentación relativa a las UCOs, expedientes de tropa, expedientes de reclutamiento para la realización del servicio militar obligatorio (en la actualidad, de los reemplazos del año 1999 hasta el 2001) y expedientes personales de cuadros de mando. Próximamente, se prevé recibir una serie de transferencias de expedientes personales de tropa profesional.
Como fondos de interés, cabe destacar los correspondientes a la Capitanía General de Levante, a la Comandancia de Obras de Levante y al Regimiento de Ferrocarriles nº 13 (perfiles e itinerarios).