La Armada ha contado con dos archivos históricos hasta 2023. El Real Decreto 33/2023 de reorganización de ambos, contempla la reordenación y ubicación de sus fondos documentales en un único archivo, el Archivo Histórico de la Armada, con dos sedes: "Juan Sebastián de Elcano" (Madrid) y "Álvaro de Bazán" (Viso del Marqués, Ciudad Real).
En virtud del citado decreto, el antiguo Archivo General de la Marina “Álvaro de Bazán” creado en el año 1948 para recoger toda la documentación histórica de la Armada, cambia su denominación por Archivo Histórico de la Armada, sede Álvaro de Bazán, manteniendo el carácter de archivo nacional y de titularidad estatal que le otorgó el Real Decreto 2598/1998, de 4 de diciembre, por el que se aprobó el Reglamento de Archivos Militares. Se integra en el Sistema Archivístico de la Defensa a través del Subsistema Archivístico de la Armada.
Se encuentra ubicado en la localidad de Viso del Marqués (Ciudad Real), en el Palacio de los Marqueses de Santa Cruz, construido en el siglo XVI y declarado monumento nacional en 1931. El palacio fue cedido a la Armada en régimen de alquiler por una cantidad simbólica, de una peseta al año, durante un plazo prorrogable de noventa años, plazo que recientemente ha sido renovado.
Consta de dos plantas y la mayoría de sus salas, así como las galerías altas y baja y la escalera, están pintadas al fresco. El Archivo se encuentra instalado en las salas o dependencias que no tienen decoración pictórica (salvo la Sala de Ulises que se utiliza como Sala de Investigadores).
