Sala “Churruca”
En esta sala se exponen cartografía de las posesiones españolas en el continente americano y filipino y maquetas de diferentes tipos de navíos.
Sala “Méndez Núñez”
Esta sala expone material de buceo, trajes y escafandras para buzos de gran profundidad. Destaca una máquina manual fabricada en Londres en el año 1914 para dar aire a los buzos.
Sala “Almirante Ferrándiz”
Muestra numerosos documentos cartográficos de las islas del archipiélago. Tiene especial relevancia la correspondiente al siglo XVIII.
Sala “Alcalá Galiano”
Presenta la colección de retratos al óleo de los almirantes jefes de la zona marítima. Son los fondos más antiguos del museo.
Sala “Soldado Manuel Lois”
Reúne armas, uniformes y material del Cuerpo de Infantería de Marina. Destaca la bandera de combate de la Agrupación de Canarias recientemente disuelta.
Sala “Jorge Juan”
En esta sala se encuentras fotos de tipos de buques de la armada y sus principales características.
Sala “Malaspina”
Esta sala contiene instrumentos náuticos y modelos, destacando el del remolcador Las Palmas y la bandera naval de Canarias hasta el año 1975.
Algunos bienes culturales, dado su gran tamaño, como por ejemplo los cañones del crucero Canarias, se pueden contemplar en los diferentes espacios ajardinados del arsenal.